Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM4

Bsnd, Barttin, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsndQ8VIM4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BsndQ8VIM4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BsndQ8VIM4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms