Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Odf4Q8VI88 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Odf4Q8VI88 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Odf4Q8VI88 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Odf4Q8VI88 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf4Q8VI88 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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