Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smg8Q8VE18 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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