Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stx18Q8VDS8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stx18Q8VDS8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms