Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TgdsQ8VDR7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms