Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rpusd1Q8VCZ8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rpusd1Q8VCZ8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpusd1Q8VCZ8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpusd1Q8VCZ8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpusd1Q8VCZ8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rpusd1Q8VCZ8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpusd1Q8VCZ8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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