Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Fam20bQ8VCS3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Fam20bQ8VCS3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam20bQ8VCS3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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