Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ApobrQ8VBT6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms