Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkl1Q8K4J6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mkl1Q8K4J6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms