Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms