Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
OptnQ8K3K8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OptnQ8K3K8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms