Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MyripQ8K3I4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MyripQ8K3I4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms