Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Lrrtm1Q8K377 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Lrrtm1Q8K377 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Lrrtm1Q8K377 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Lrrtm1Q8K377 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Lrrtm1Q8K377 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Lrrtm1Q8K377 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lrrtm1Q8K377 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lrrtm1Q8K377 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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