Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssh3Q8K330 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssh3Q8K330 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms