Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms