Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms