Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hacd3Q8K2C9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms