Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mtmr3Q8K296 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Mtmr3Q8K296 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Mtmr3Q8K296 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Mtmr3Q8K296 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Mtmr3Q8K296 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mtmr3Q8K296 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms