Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Abcf3Q8K268 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Abcf3Q8K268 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Abcf3Q8K268 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms