Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Stx5Q8K1E0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stx5Q8K1E0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms