Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8K039 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8K039 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8K039 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8K039 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8K039 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8K039 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8K039 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8K039 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8K039 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8K039 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q8K039 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8K039 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8K039 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8K039 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8K039 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q8K039 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms