Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TwnkQ8CIW5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TwnkQ8CIW5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.1 ms