Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms