Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upp2Q8CGR7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms