Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1rbQ8CFG9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms