Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc87Q8CDL9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms