Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsun3Q8CCT7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nsun3Q8CCT7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms