Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slfn5Q8CBA2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms