Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fbxo48Q8CAT8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms