Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Aph1bQ8C7N7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Aph1bQ8C7N7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Aph1bQ8C7N7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Aph1bQ8C7N7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aph1bQ8C7N7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Aph1bQ8C7N7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms