Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cwc22Q8C5N3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms