Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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