Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx16Q8C080 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snx16Q8C080 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snx16Q8C080 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snx16Q8C080 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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