Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim35Q8C006 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm21064-201ENSMUST00000189723 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim35Q8C006 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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