Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh12Q8BYK4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh12Q8BYK4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms