Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sec22cQ8BXT9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms