Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Cldn17Q8BXA6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Cldn17Q8BXA6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cldn17Q8BXA6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Cldn17Q8BXA6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn17Q8BXA6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cldn17Q8BXA6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cldn17Q8BXA6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cldn17Q8BXA6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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