Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms