Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms