Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup54Q8BTS4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms