Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbrm1Q8BSQ9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbrm1Q8BSQ9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbrm1Q8BSQ9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbrm1Q8BSQ9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbrm1Q8BSQ9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pbrm1Q8BSQ9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Pbrm1Q8BSQ9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pbrm1Q8BSQ9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pbrm1Q8BSQ9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pbrm1Q8BSQ9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pbrm1Q8BSQ9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pbrm1Q8BSQ9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms