Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8BP99 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BP99 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BP99 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8BP99 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BP99 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BP99 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BP99 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BP99 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8BP99 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BP99 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Q8BP99 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BP99 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BP99 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BP99 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BP99 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BP99 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms