Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tspan12Q8BKT6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms