Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rufy1Q8BIJ7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rufy1Q8BIJ7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms