Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra5Q8BHJ7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms