Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmco3Q8BH01 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmco3Q8BH01 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms