Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AW551984Q8BGF0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms