Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms