Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubp1Q811S7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms