Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smim19Q80ZU4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim19Q80ZU4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim19Q80ZU4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim19Q80ZU4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim19Q80ZU4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim19Q80ZU4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim19Q80ZU4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim19Q80ZU4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim19Q80ZU4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smim19Q80ZU4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim19Q80ZU4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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